這座世界上最大的木造建築物，雖然其後再未遭受火患而迎來了明治時期，但整體上傷痕累累，副梁的支撐岌岌可危。為此，明治三十九年（1906）開始，著手對其進行解體修理，同時導入了內部以鐵架加固等新方法，工程於明治四十五年（1912）完成。但似乎由於屋梁部分的工事有問題，使得不時可以在殿內見到雨水；因此從昭和四十八年（1973）開始花費七年時間進行了大修理。昭和五十五年（1980）秋，舉行了盛大的落成慶祝法要。